Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG7O95352 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG7O95352 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG7O95352 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG7O95352 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG7O95352 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG7O95352 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG7O95352 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG7O95352 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG7O95352 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG7O95352 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG7O95352 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATG7O95352 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATG7O95352 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATG7O95352 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATG7O95352 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATG7O95352 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATG7O95352 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATG7O95352 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATG7O95352 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG7O95352 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG7O95352 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG7O95352 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG7O95352 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG7O95352 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG7O95352 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG7O95352 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG7O95352 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG7O95352 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG7O95352 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG7O95352 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG7O95352 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG7O95352 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATG7O95352 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms