Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TXNDC9O14530 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms