Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMBRD1Q9NUN5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms