Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRJQ12913 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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