Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms