Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC6A3Q01959 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms