Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MYBPC1Q00872 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms