Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2E2P29084 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2E2P29084 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms