Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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PTPRBP23467 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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PTPRBP23467 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PTPRBP23467 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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PTPRBP23467 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRBP23467 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PTPRBP23467 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PTPRBP23467 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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