Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms