Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPCP11686 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPCP11686 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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