Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSF2P04141 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSF2P04141 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF2P04141 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms