Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGFB1P01137 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms