Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOC4-APOC2K7ER74 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC4-APOC2K7ER74 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms