Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM247A6NEH6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms