Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1024Q9UPX6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms