Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC00474Q9P2X8 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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LINC00474Q9P2X8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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LINC00474Q9P2X8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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LINC00474Q9P2X8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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LINC00474Q9P2X8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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