Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCM2LQ9NUG4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms