Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLRP1Q9C000 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms