Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EBF4Q9BQW3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms