Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TMCO5AQ8N6Q1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TMCO5AQ8N6Q1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TMCO5AQ8N6Q1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TMCO5AQ8N6Q1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TMCO5AQ8N6Q1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TMCO5AQ8N6Q1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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