Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRRQ15256 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PTPRRQ15256 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PTPRRQ15256 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PTPRRQ15256 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PTPRRQ15256 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PTPRRQ15256 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PTPRRQ15256 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRRQ15256 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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