Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms