Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MYCBPQ99417 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms