Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MVB12AQ96EY5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms