Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHFRQ96EP1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms