Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms