Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL28Q13084 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms