Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms