Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms