Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK1EP49674 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms