Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA3P35244 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA3P35244 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA3P35244 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA3P35244 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA3P35244 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA3P35244 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA3P35244 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA3P35244 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA3P35244 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA3P35244 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPA3P35244 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPA3P35244 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA3P35244 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA3P35244 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA3P35244 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms