Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
BMI1P35226 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BMI1P35226 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BMI1P35226 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BMI1P35226 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BMI1P35226 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BMI1P35226 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BMI1P35226 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BMI1P35226 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BMI1P35226 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
BMI1P35226 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms