Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCAP17252 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCAP17252 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCAP17252 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCAP17252 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCAP17252 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCAP17252 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCAP17252 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCAP17252 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCAP17252 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCAP17252 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCAP17252 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms