Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4DXG7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4DXG7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B4DXG7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms