Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX8Q9Y5X2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms