Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM3Q9BZL3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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