Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.323e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SZRD1-202ENST00000401089 3447 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.723e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SZRD1-210ENST00000492354 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.743e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.963e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.053e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 BAG6-249ENST00000441793 783 ntTSL 214.31□□□□□ -0.128e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 BAG6-238ENST00000422948 513 ntTSL 28.44□□□□□ -1.068e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.133e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MAPK12-204ENST00000467891 2019 ntTSL 532.43■■■□□ 2.782e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TMEM134-208ENST00000536020 680 ntTSL 331.18■■■□□ 2.582e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TYMP-206ENST00000476284 1572 ntTSL 531.04■■■□□ 2.562e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TYMP-205ENST00000425169 1432 ntTSL 530.54■■■□□ 2.482e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.472e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.42e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.252e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.242e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.22e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.087e-7■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.072e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.072e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 NTHL1-203ENST00000561862 564 ntTSL 227.85■■■□□ 2.052e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.022e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TYMP-208ENST00000487577 1751 ntTSL 1 (best)27.6■■■□□ 2.012e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.012e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TMEM134-217ENST00000545682 1063 ntTSL 1 (best)27.48■■□□□ 1.992e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.892e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SCO2-206ENST00000638670 617 ntTSL 226.7■■□□□ 1.862e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.862e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.812e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.87e-7■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PTRHD1-205ENST00000487316 1014 ntTSL 226.08■■□□□ 1.772e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNPS1-218ENST00000566180 814 ntTSL 525.66■■□□□ 1.73e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MAPK12-206ENST00000488504 1785 ntTSL 525.59■■□□□ 1.692e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.632e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.562e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 YIPF2-208ENST00000589971 879 ntTSL 224.75■■□□□ 1.553e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.552e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TMEM50A-206ENST00000498135 776 ntTSL 324.64■■□□□ 1.542e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.533e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNPS1-226ENST00000570051 735 ntTSL 224.62■■□□□ 1.533e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNPS1-212ENST00000564822 314 ntTSL 424.62■■□□□ 1.533e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ABCA7-204ENST00000524383 389 ntTSL 324.3■■□□□ 1.482e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 NTHL1-206ENST00000565406 691 ntTSL 224.12■■□□□ 1.452e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 CHD3-204ENST00000439235 1263 ntTSL 523.92■■□□□ 1.426e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 AKT1-215ENST00000555926 553 ntTSL 323.69■■□□□ 1.383e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.382e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.381e-13■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.377e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TMEM50A-203ENST00000480937 1102 ntTSL 223.61■■□□□ 1.372e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNPS1-210ENST00000564601 903 ntTSL 323.23■■□□□ 1.313e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.292e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TMEM134-213ENST00000541059 716 ntTSL 323.04■■□□□ 1.282e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.272e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DYRK3-205ENST00000489878 1772 ntTSL 1 (best)22.66■■□□□ 1.223e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.183e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.183e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TESC-207ENST00000549210 422 ntTSL 222.37■■□□□ 1.172e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MATK-205ENST00000587180 741 ntTSL 522.31■■□□□ 1.162e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.122e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.95■■□□□ 1.12e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 YIPF2-212ENST00000592646 950 ntTSL 321.85■■□□□ 1.093e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.092e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.073e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MTHFD1L-206ENST00000423867 524 ntTSL 221.69■■□□□ 1.066e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.063e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.032e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 E2F4-208ENST00000567007 2615 ntTSL 221.45■■□□□ 1.022e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.012e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.973e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.966e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DBNL-201ENST00000411855 1447 ntTSL 221■□□□□ 0.957e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TMEM134-205ENST00000535175 565 ntTSL 220.98■□□□□ 0.952e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 NTHL1-208ENST00000567727 568 ntTSL 220.85■□□□□ 0.932e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.922e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MRPL3-209ENST00000511168 1377 ntTSL 220.82■□□□□ 0.922e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TMEM50A-202ENST00000468704 799 ntTSL 320.76■□□□□ 0.912e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.913e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.893e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ABCA7-219ENST00000612569 876 ntTSL 320.56■□□□□ 0.882e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNPS1-217ENST00000565870 1514 ntTSL 1 (best)20.55■□□□□ 0.883e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.857e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ATG13-206ENST00000526485 637 ntTSL 520.38■□□□□ 0.854e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNPS1-204ENST00000561518 1092 ntTSL 520.3■□□□□ 0.843e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MAPK12-209ENST00000497036 6248 ntTSL 220.29■□□□□ 0.842e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.822e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 NTHL1-207ENST00000566380 814 ntTSL 320.09■□□□□ 0.812e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.796e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.782e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DNAJC4-206ENST00000537109 1340 ntTSL 219.91■□□□□ 0.782e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SRRT-212ENST00000487311 563 ntTSL 219.88■□□□□ 0.772e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.763e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.753e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.753e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.732e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 MRM2-204ENST00000467199 1819 ntTSL 219.35■□□□□ 0.692e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 DNAJC4-209ENST00000542376 546 ntTSL 219.34■□□□□ 0.692e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 RNPS1-208ENST00000563857 739 ntTSL 219.34■□□□□ 0.693e-8■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.666e-10■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 NTHL1-205ENST00000562951 523 ntTSL 319.12■□□□□ 0.652e-6■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 TMEM134-215ENST00000543661 610 ntTSL 219.03■□□□□ 0.642e-6■■□□□ 11.4
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