Protein–RNA interactions for Protein: Q04726

TLE3, Transducin-like enhancer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE3Q04726 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TLE3Q04726 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms