Protein–RNA interactions for Protein: P51164

ATP4B, Potassium-transporting ATPase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4BP51164 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4BP51164 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms