Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP3P42574 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP3P42574 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP3P42574 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP3P42574 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP3P42574 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP3P42574 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP3P42574 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP3P42574 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms