Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRG2P13727 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRG2P13727 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms