Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIN1Q9NXP7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GIN1Q9NXP7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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