Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms