Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP4Q96P64 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP4Q96P64 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP4Q96P64 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP4Q96P64 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP4Q96P64 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP4Q96P64 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP4Q96P64 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP4Q96P64 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP4Q96P64 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP4Q96P64 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP4Q96P64 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP4Q96P64 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP4Q96P64 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGAP4Q96P64 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP4Q96P64 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms