Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms