Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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