Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DNASE1L3Q13609 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms