Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMD2Q13200 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms