Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF3P78545 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF3P78545 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF3P78545 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ELF3P78545 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ELF3P78545 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ELF3P78545 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms